报告题目:基于矩阵完成和网络算法的非编码RNA和疾病关系预测
报告人:杨家亮 美国西奈山医学院高级研究科学家
报告时间:2018年11月27日星期二下午3:00—4:30
报告地点:我院3401学术报告厅
摘要:近期研究发现非编码RNA在基因调控中起着重大的作用,并和多种疾病息息相关。本报告将介绍两个预测非编码RNA和疾病关系的机器学习算法。BPLLDA首先构建关于长非编码RNA和疾病关系的异质网络,并通过网络顶点间的路径长度预测非编码RNA和疾病的关系。LRMCMDA构建了一个带惩罚项的矩阵完成算法,并通过交叉梯度下降算法求解,以预测小RNA和疾病的关系。交叉验证的结果证明这两个算法优于目前常用的几种计算方法。
报告人:杨家亮(博士)。目前是美国西奈山医学院高级研究科学家,主要方向为关于单细胞测序和疾病的机器学习算法研究。目前已发表SCI学术论文60余篇,其中一作和通讯作者文章30余篇。多篇一作和通讯作者文章发表于生物信息学顶级期刊如Molecular Biology and Evolution、mBio、Bioinformatics等,并参与了两篇Science和一篇Cell Metabolism文章。